Programme de compétence de PulseNet Canada
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2 à 6 isolats pouvant appartenir à l'un des genres suivants : Escherichia coli, Shigella spp., Listeria monocytogenes, Salmonella spp.
L'essai de compétence FASTQ pour le séquençage du génome entier (SGE) consiste à générer des données de SGE à partir des isolats de l'essai. L'essai de compétence pour l'analyse du SGE consiste à évaluer la qualité et à analyser les données générées à partir des souches de l'essai.
Détermination des notes attribuées : Les notes sont déterminées en fonction des résultats obtenus à partir du même ensemble d’isolats au Laboratoire national de PulseNet Canada.
Évaluation des performances : Les soumissions pour l’essai de compétence FASTQ sont évaluées en fonction de la conformité des isolats soumis aux critères de qualité minimaux requis, spécifiés dans le dossier d’instructions de l’essai.
Les soumissions de l'essai de compétence en analyse sont évaluées en fonction de la capacité des participants à identifier correctement les isolats concernés et à évaluer correctement si la qualité des données répond aux critères de qualité minimaux requis spécifiés dans le dossier d'instructions de l'essai de compétence.
L’épreuve de compétence de la méthode de SGE au format FASTQ vise la production de données de SGE aux fins d’analyse en aval. L’épreuve de compétence de l’analyse par SGE comprend une évaluation de la qualité et une analyse des données de SGE. Les laboratoires doivent démontrer leur compétence tous les ans pour garder leur accès aux bases de données nationales et pour pouvoir transmettre des données à PulseNet Canada.
Il n’y a pas de frais de participation.
Tout laboratoire (régional ou national) certifié par PulseNet Canada recevra chaque année le panel de vérification de la compétence approprié.
Les coordonnées des participants et les résultats sont des renseignements confidentiels. Les résultats de la certification sont communiqués uniquement au participant demandeur.
Les laboratoires participants n’ont pas besoin de faire une demande. Le panel de vérification de la compétence est distribué tous les ans aux laboratoires certifiés par PulseNet Canada.