Identification

Identification de Shigella spp. présumée.

Isolat provenant d'urine, de selles, de sang, de l'environnement, d'aliments ou d'autres sources.

Isolat fourni sur un milieu de culture approprié présentant une croissance visible. Les échantillons peuvent également être envoyés congelés, à condition qu’ils soient expédiés dans un milieu approprié permettant leur survie pendant le transport.

Envoyer sous forme de culture sur un milieu de culture approprié ou dans un milieu de transport approprié. Les échantillons congelés doivent être expédiés sur de la glace carbonique ou par une autre méthode garantissant qu’ils restent congelés.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Shigellose

Formulaire de requête des maladies entériques dûment rempli.

S/O

Identification phénotypique :
Biotypage (tests d'utilisation de substrats biochimiques)
Sérotypage (test d'agglutination sérique)*

Identification moléculaire :
Des méthodologies basées sur le séquençage du génome entier peuvent être utiliséespour faciliter la confirmation de l'espèce (Non accrédité selon la norme ISO/IEC 17025 à l'heure actuelle ; ECTyper n'est pas validé pour l'identification de Shigella spp. à l'heure actuelle)

*Veuillez contacter le service des maladies entériques pour obtenir des informations sur l'interprétation du sérotypage de Shigella.

Pour les échantillons de diagnostic clinique ou liés à une épidémie^ : 28 jours calendaires.

Pour les échantillons de surveillance ou de recherche^ : 3 mois

^Veuillez indiquer sur la demande si l'identification est destinée i) à un diagnostic clinique ou à une épidémie OU ii) à une application de surveillance ou de recherche.
Les délais d'exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés en cas d'épidémie alimentaire majeure ou en raison d'une disponibilité limitée des ressources

Veuillez noter que pour les organismes à croissance lente ou difficile, la communication des résultats peut être retardée au-delà des délais d'exécution indiqués.

1. Murray, P.R., Baron, E.J., Jorgensen, J.H., Pfaller, M.A., Yolken, R.H., Manual of Clinical Microbiology. 2003. ASM Press. Washington, DC. USA
2. Bessonov K, Laing C, Robertson J, Yong I, Ziebell K, Gannon VPJ, Nichani A, Arya G, Nash JHE, Christianson S. ECTyper: in silico Escherichia coli serotype and species prediction from raw and assembled whole-genome sequence data. Microb Genom. 2021