Détection moléculaire par PCR en temps réel et Spéciation par PCR conventionnelle
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Détails de la référence
Détection moléculaire par PCR en temps réel et spéciation des espèces rickettsies.
- Typhus endémique (typhus murin)
- Typhus épidémique
- Rickettsioses du groupe des typhus
Sang total – minimum 1.0 mL. Tissu – Biopsie de l’escarre.
Sang total: tube EDTA. Tissu ou écouvillonnage: soumettre dans un tube à prélèvement stérile.
Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu’à leur envoi pour analyse. Les échantillons de tissu doivent être congelés jusqu’à leur envoi pour analyse. Expédier le sang total à 4oC; expédier les tissus congelés.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Infection à rickettsies présumée.
Requête d’analyse pour les rickettsies et maladies zoonotiques apparentées dûment remplie : nom, adresse et numéro de téléphone de l’expéditeur; nom ou code d’identification (numéro du laboratoire demandeur) et date de naissance du patient; exposition suspectée; test(s) requis; antécédents cliniques et date d’apparition des symptômes; type d’échantillon et date de prélèvement. Si possible, indiquer les antibiotiques administrés et les antécédents de voyage.
On procédera à la spéciation des échantillons positifs par PCR conventionnelle et séquençage.
Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une épreuve mise au point en laboratoire qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée, car il n’y a pas de panel bien caractérisé.
La PCR en temps réel est réalisée à l’aide d’essais spécifiques pour le gène de l’antigène de 17 kDa et le gène de la citrate synthase du genre Rickettsia. Si un échantillon s’avérait positif par PCR en temps réel, une épreuve PCR conventionnelle et un séquençage du gène de la protéine de membrane externe seront effectués pour identifier l’espèce exacte du groupe des fièvres pourprées. Pour la détection spécifique de R. prowazekii, une épreuve spécifique pour le gène citrate synthase de cette espèce est effectuée.
15 jours civils.
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