Détection moléculaire

Détection moléculaire d’espèces de Leptospira dans des échantillons cliniques.

Sang total, urine, tissu ou liquide céphalo-rachidien (LCR). Les volumes minimaux requis sont les suivants :

• Sang total – 0,5 ml
• Urine (fraîche) – 5 ml
• Tissu – 1 à 5 mg
• LCR – 0,5 ml
  

Recueillir le sang total dans des tubes EDTA. Évitez l’héparine. Ne pas centrifuger. Prélever l’échantillon aseptiquement dans un contenant étanche et stérile, en plastique résistant aux cycles gel-dégel et aux chocs, sans agent de conservation.

Garder au réfrigérateur des spécimens durant une période pouvant aller jusqu’à 5 jours en attendant qu’il soit expédié avec des blocs réfrigérants pour analyse. Si le délai est supérieur à 5 jours, conserver à -20 °C et expédier sur de la glace sèche.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Les symptômes d’une infection à Leptospira spp. peuvent comprendre les suivants : fièvre, céphalées, frissons, malaise général, éruption cutanée, vomissements, diarrhée, myalgies, suffusion conjonctivale, ictère, insuffisance rénale et/ou défaillance hépatique, méningite et douleurs thoraciques. Contact avec un animal infecté (chiens, bétail, ratons laveurs, rongeurs, etc.) ou voyage récent dans une région ou l’infection à Leptospira spp. est endémique.

Requête pour l’analyse moléculaire de certains agents de zoonoses dûment complétée.

Les échantillons qui ne constituent pas le bon type d’échantillon, dont le volume est insuffisant, ou ne sont pas accompagnés des renseignements pertinents sur le patient ou des antécédents cliniques de ce dernier peuvent être rejetés. Cette analyse est effectuée à des fins d’enquête.

Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une épreuve mise au point en laboratoire qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée.

L’ADN extrait est analysé par des dosages PCR en temps réel interne spécifiques à Leptospira spp. Les échantillons dont le résultat est positif sont soumis à des tests de confirmation.La mise en œuvre d’un traitement antibiotique avant le test peut entraîner une diminution de la quantité d’ADN génomique bactérien, ce qui aura une incidence sur le résultat du test de PCR.

21 jours civils.

1. Levett, P.N. Leptospirosis (2001) Clin. Micro. Rev. (14): 296-326.
2. Stoddard R. A., Gee J. E., Wilkins P. P., McCaustland K., et al.2009. Detection of pathogenic Leptospira spp. through TaqMan polymerase chain reaction targeting the LipL32 gene. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 64:247–255.
3. Mohd Ali, MR et. al., Development and validation of pan-Leptospira Taqman qPCR for the detection of Leptospira spp. in clinical specimens. Molec and Cell Probes 38 (2018) 1-6