Sérotypage
<<Retourner au laboratoire*Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)
Formulaires de demande
Détails de la référence
Sérotypage d’Escherichia coli.
- Gastro-entérite
- Septicémie
- Bactériémie
- Méningite néonatale
Isolat obtenu à partir des urines, des selles, du sang, de l’environnement, d’un aliment, etc.
Isolat fourni sur un milieu de culture approprié pour E. coli.
Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié. Le récipient de culture doit être étanche ou adéquatement scellé.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Gastro-entérite, septicémie, infection ou autres.
Formulaire de requête d’analyse pour la Division des maladies entériques dûment rempli.
S/O
Prédiction du sérotype in silico (ECTyper)* (méthode principale)(1)
Épreuve d’agglutination* (méthode secondaire/de confirmation)(2)
Remarque : Tous les isolats d’E. coli feront l’objet d’un séquençage du génome entier et d’une prédiction du sérotype in silico. Si un sérotypage classique est requis, prenez soin de l’indiquer sur le formulaire de requête d’analyse pour la Division des maladies entériques
- Prédiction du sérotype in silico selon Bessonov K, Laing C, Robertson J, Yong I, Ziebell K, Gannon VPJ, Nichani A, Arya G, Nash JHE, Christianson S. ECTyper: in silico Escherichia coli serotype and species prediction from raw and assembled whole-genome sequence data. Microb Genom. 2021 Dec;7(12):000728. doi: 10.1099/mgen.0.000728. PMID: 34860150; PMCID: PMC8767331.
- Gross RJ, Rowe B. The serotyping of Escherichia coli In: Sussman M, ed. The Virulence of Escherichia coli: Reviews and Methods. London: Society for General Microbiology, Academic Press, 1985:345-63
21 jours civils. À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.
Fiche Technique Santé-Sécurité : Agents Pathogènes – Escherichia coli entéro-hémorragique
Fiche Technique Santé-Sécurité : Agents Pathogènes – Escherichia coli, enteroinvasive
Fiche Technique Santé-Sécurité : Agents Pathogènes – Escherichia coli, enteropathogenic
Fiche Technique Santé-Sécurité : Agents Pathogènes – Escherichia coli, enterotoxigenic