Détection moléculaire par PCR et séquençage

Détection moléculaire de Borrelia burgdorferi sensu lato dans des échantillons cliniques.

LES TESTS SONT EFFECTUÉS UNIQUEMENT SUR DEMANDE SPÉCIALE ET APRÈS CONSULTATION PRÉALABLE AVEC LE LABORATOIRE.

Liquide synovial, liquide céphalo-rachidien (LCR) ou biopsie tissulaire. Pour réaliser ce test, un échantillon de sérum antérieur doit avoir donné un résultat positif aux anticorps anti-Borrelia burgdorferi.

Les volumes minimaux requis sont les suivants :
Liquide synovial – 0,6 ml
LCR – 0,6 ml.
Tissu frais (biopsie cutanée) – 1 à 5 mg

Prélever aseptiquement LCR ou liquide synovial dans un contenant étanche et stérile sans additif.

Tissu frais ou inclus en paraffine :

• Laver le site de la biopsie avec un savon antiseptique. Rincer à fond la région avec de l’eau stérile. Ne pas utiliser d’alcool ni de préparation à base d’iode. Un anesthésique local peut être utilisé. 
• Prélever une biopsie à l’emporte-pièce comprenant l’épaisseur complète du derme. Placer les tissus dans une gaze imbibée de solution saline et mettre dans un contenant étanche et stérile renfermant 2 mL de solution saline.

Conserver les échantillons au réfrigérateur jusqu’à cinq jours et les expédier avec des blocs réfrigérants. Si le délai est supérieur à 5 jours, conserver à -20°C et expédier sur de la glace sèche.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Symptômes cliniques appropriés associés à une exposition potentielle aux tiques du genre Ixodes. Les symptômes typiques comprennent de la fièvre, des maux de tête, de la fatigue, et une éruption cutanée caractéristique peut être présente. Si elle n’est pas traitée, l’infection peut se propager aux articulations, au cœur et au système nerveux. Le patient doit avoir obtenu un résultat positif lors d’un test antérieur selon l’algorithme sérologique MTTT ou STTT de la maladie de Lyme pour que le test PCR soit envisagé.

Demande de tests moléculaires pour certains agents pathogènes transmis par des vecteurs et certains agents zoonotiques. Si possible, veuillez joindre les antécédents cliniques et les résultats des analyses effectuées dans des laboratoires locaux ou provinciaux.

Les spécimens peuvent être refusés s’ils ne correspondent pas au type d’échantillon approprié, s’ils n’ont pas un volume suffisant ou s’ils ne sont pas accompagnés de la symptomatologie pertinente, de la date de manifestation des symptômes et des renseignements sur le patient. Cette analyse est effectuée à des fins d’enquête.

Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une épreuve mise au point en laboratoire qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée.

L’ADN extrait est analysé au moyen d’un dosage d’amplification par la polymérase (PCR) en temps réel qui détecte spécifiquement les espèces de Borrelia. Les échantillons dont le test est positif sont soumis à des tests de confirmation

La mise en œuvre d’un traitement antibiotique avant le test peut entraîner une diminution de la quantité d’ADN génomique bactérien, ce qui aura une incidence sur le résultat du test de PCR.

21 jours civils.

1. Courtney, J.W., Kostelnik, L.M., Zeidner, N.S., Massung, R.F. 2004. Multiplex real-time PCR for detection of Anaplasma phagocytophilum and Borrelia burgdorferi. J. Clin. Micro. 42(7):3164-3168.
2. Tokarz R, Tagliafierro T, Cucura DM, Rochlin I, Sameroff S, Lipkin WI. 2017. Detection of Anaplasma phagocytophilum, Babesia microti, Borrelia burgdorferi, Borrelia miyamotoi, and Powassan virus in ticks by a multiplex realtime reverse transcription-PCR assay.Ticks Tick Borne Dis. 2014 Apr;5(3):349-51
3. Pritt, B. S., Mead, P. S., Hoang Johnson, D. K., Neitzel, et. al. 2016. Identification of a novel pathogenic Borrelia species causing Lyme borreliosis with unusually high spirochaetaemia: a descriptive study. The Lancet. Infectious Diseases, 16(5),556–564.