Détection moléculaire du virus Andes
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Détails de la référence
Amplification du génome de virus Andes.
- Syndrome cardiopulmonaire dû au hantavirus (SPH)
Sang total, sérum, LCR, autres liquides organiques (échantillon minimum de 0,5 ml) et tissus frais congelés. Tissus fixés au formol et/ou inclus en paraffine.
Sérum : Recueillir dans des tubes à sérum (avec bouchon rouge) ou dans des tubes séparateurs de sérum (TSS). La centrifugation des tubes à sérum n’est pas nécessaire et doit en fait être évitée.
Sang total : Prélever dans des tubes avec EDTA, héparine ou citrate. Peut être envoyé en aliquotes dans des tubes stériles à bouchon à vis de 1,5 à 2,0 ml.
LCR et autres liquides organiques : Prélever les échantillons dans des tubes stériles à bouchon à vis de 1,5 à 2,0 ml.
Tissus : Les tissus frais congelés doivent être placés dans des récipients en plastique. Les tissus fixés au formol doivent également être envoyés dans des conteneurs en plastique et être clairement identifiés comme étant fixés au formol. Les tissus inclus en paraffine peuvent être envoyés en blocs entiers ou en quatre à six sections de 10 µm dans un tube ou un flacon en plastique.
Conserver les échantillons au réfrigérateur ou au congélateur jusqu’à leur expédition pour analyse. Le sérum peut être expédié réfrigéré ou congelé. Éviter de congeler les échantillons de sang total. Les tissus doivent être expédiés congelés. Expédier des échantillons congelés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur de la glace humide. Les échantillons fixés au formol peuvent être envoyés à température ambiante.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Symptomatique et antécédents d'une exposition à des rongeurs ou à leurs excréments.
Requête d'Agents pathogènes spéciaux complétée incluant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone de l'expéditeur. L'information chez le patient incluant le nom du patient ou identifiant, la date de naissance, et tout antécédent pertinent, y compris le diagnostic clinique, les maladies sous jacentes, le risque d'exposition et historique des déplacements. Indiquez le type d'échantillon prélevé et fournissez tous les renseignements sur les échantillons. Choisissez toutes les analyses requises. Dans la mesure du possible, annexez les résultats des tests de laboratoire déjà réalisés par un laboratoire local ou provincial.
La sérologie est la méthode par excellence pour identifier une infection à hantavirus. Tous les tests par PCR doivent être effectués en parallèle avec une sérologie dans le type d’échantillon approprié.
Les antécédents du patient doivent être inclus; les échantillons non accompagnés d’antécédents suffisants pour justifier une analyse sont susceptibles d’être rejetés.
Le test PCR est validé.
Dans le cas du diagnostic du syndrome cardiopulmonaire dû au hantavirus (SPH) ou de la Fièvre hémorragique avec syndrome rénal (HFRS) en attente de confirmation, on doit obtenir un ou plusieurs résultats positifs concernant les marqueurs diagnostiques suivants : (i) Présence d'IgM dirigé contre l'hantavirus ou titre croissant d'IgG, (ii) présence d'ARN du virus de l'hantavirus révélée par PCR.
14 jours civils.