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Détection moléculaie

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Détails de la référence

Description:

Détection moléculaire d'Anaplasma phagoctyophilum dans des échantillons cliniques.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire et Génotypage
Agent pathogène:
Anaplasma phagocytophilum
Infections et maladies:
  • Anaplasmose granulocytique humain
Spécimen:

Il est recommandé d’utiliser des échantillons de sang entier ou de couche leucoplaquettaire. Les échantillons de liquide céphalorachidien (LCR) provenant de patients dont l’état clinique indique une méningite ou les échantillons de sérum sont acceptables.

Volume minimum requis:

5,0 mL pour le sang total

0,5 mL pour la couche leucoplaquettaire

0,5 mL pour le LSR

0,5 mL pour le sérum

Méthode de prélèvement:

Prélever le sang dans des tubes EDTA.  évitez l'héparine. Ne pas centrifuger. Prélever aseptiquement une couche leuco-plaquettaire, du LCR ou de sérum dans un contenant étanche et stérile fait de plastique résistant aux cycles gel-dégel et aux chocs, sans agent de conservation.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Conserver les échantillons au réfrigérateur jusqu’à 5 jours et les expédier avec des blocs réfrigérants. Si le délai est supérieur à 5 jours, conserver à -20 °C et expédier sur de la glace sèche.

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Symptômes cliniques appropriés apparus dans les 5 à 21 jours suivant une exposition possible à des tiques du genre Ixodes. Les signes cliniques d’anaplasmose comprennent l’installation brutale de fièvre accompagnée d’un ou plusieurs des symptômes non spécifiques suivants : frissons, malaise, maux de tête, douleurs musculaires, douleurs articulaires, leucopénie, thrombopénie et élévation des transaminases hépatiques.

Documents d'accompagnement:

Requête pour l’analyse moléculaire de certains agents de zoonoses dûment complétée.  Si possible, fournir les antécédents cliniques et les résultats d’analyses effectuées par le laboratoire provincial ou local. 

Commentaires:

Les échantillons qui ne constituent pas le bon type d’échantillon, dont le volume est insuffisant, ou ne sont pas accompagnés des renseignements pertinents sur le patient peuvent être rejetés. Cette analyse est effectuée à des fins d’enquête.

Méthodes et interprétation des résultats:

Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une épreuve mise au point en laboratoire qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée.

L’ADN extrait fait l’objet d’une analyse par PCR maison en temps réel visant à détecter A. phagocytophilum. Si le résultat de l’analyse par PCR en temps réel est positif, les échantillons sont soumis à des analyses de confirmation par PCR en temps réel et peuvent être analysés par PCR classique et séquençage aux fins de détermination de la souche.

Le résultat de l’épreuve PCR pourrait être affecté lorsqu’un traitement par antibiotique est initié avant l’analyse (génome réduit de la bactérie). 

Délai d'exécution:

21 jours civils.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6068
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Massung, R.F., Owens, J.H., Ross, D., et al. 2000. Sequence analysis of the ank gene of granulocytic ehrlichiae. J. Clin. Microbiol. 38(8):2917-2922.
  2. Courtney, J.W., Kostelnik, L.M., Zeidner, N.S., Massung, R.F. 2004. Multiplex real-time PCR for detection of Anaplasma phagocytophilum and Borrelia burgdorferi. J. Clin. Micro. 42(7):3164-3168.
  3. Krakowetz CN, Dibernardo A, Lindsay LR, Chilton NB. 2014. Two Anaplasma phagocytophilum Strains in Ixodes      scapularis Ticks, Canada. Emerg. Inf. Dis. 20(12):2064-2067.
Fiches d'information: