Giardia duodenalis Identification

Identification de Giardia duodenalis(également connue sous le nom de Giardia lamblia ou Giardia intestinalis) et différenciation des deux principaux assemblages infectant l’humain, les assemblages A et B.

Échantillon de selles humaines

L'échantillon de selles humaines peut être frais ou conservé dans un milieu de transport tel que le Cary-Blair. Les échantillons conservés dans des fixateurs contenant du formol, tels que le SAF, ne sont pas acceptés.

Les échantillons doivent être placés dans un contenant étanche, le numéro d’échantillon devant figurer sur le tube, et toute information permettant d’identifier le patient doit avoir été retirée. La quantité minimale recommandée est de 1 gramme. Les échantillons peuvent être congelés dans de la glace sèche ou réfrigérés dans de la glace mouillée. Il faut éviter autant que possible les cycles répétés de congélation-décongélation.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Nausées, frissons, fièvre légère, douleur épigastrique et apparition soudaine d’une diarrhée aqueuse.

Formulaire de requête de l’Unité de génomique parasitaire dûment rempli.

Les échantillons conservés dans des fixateurs contenant du formol, tels que le SAF, ne sont pas acceptés.

qPCR du gène de la bêta-giardine conformément à :

1. Reaction and cycling conditions - Elwin K, Fairclough HV, Hadfield SJ, Chalmers RM. Giardia duodenalis typing from stools: a comparison of three approaches to extracting DNA, and validation of a probe-based real-time PCR typing assay. J Med Microbiol. 2014 Jan;63(Pt 1):38-44. doi: 10.1099/jmm.0.066050-0.
2. Primers - Moore CE, Elwin K, Phot N, Seng C, Mao S, Suy K, Kumar V, Nader J, Bousfield R, Perera S, Bailey JW, Beeching NJ, Day NP, Parry CM, Chalmers RM. Molecular Characterization of Cryptosporidium Species and Giardia duodenalis from Symptomatic Cambodian Children. PLoS Negl Trop Dis. 2016 Jul 7;10(7):e0004822. doi: 10.1371/journal.pntd.0004822.

7 jours calendaires. Remarque : les délais d'exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés en cas d'épidémies ou en raison d'une disponibilité limitée des ressources.