Typage moléculaire de Neisseria gonorrhoeae par séquençage de plusieurs antigènes (NG-MAST) à partir d’échantillons positifs pour la gonorrhée soumis à un test d’amplification des acides nucléiques (TAAN).

Détermination moléculaire par PCR des mutations associées à la résistance aux antimicrobiens et prédiction de la résistance aux céphalosporines, à la ciprofloxacine et à l’azithromycine.

Échantillons positifs pour la gonorrhée conservés dans un tampon APTIMA ou Roche Cobas, notamment l’urine, les prélèvements urétraux/urogénitaux, les prélèvements vaginaux et les prélèvements rectaux, ou les extraits d’ADN. L’urine non diluée et les prélèvements pharyngés ne sont pas recommandés.
D’autres types d’échantillons peuvent être acceptés s’ils sont justifiés par une raison valable ou sur autorisation préalable de la Section des maladies bactériennes invasives. Le volume minimum requis est de 1 ml. Ne soumettez qu’un seul test GC TAAN par cas, sauf dans le cadre d’une enquête sur un échec thérapeutique.

Les échantillons peuvent être refusés s’ils ne correspondent pas au type d’échantillon approprié, si leur volume est insuffisant ou s’ils ne sont pas accompagnés des informations pertinentes sur le patient.

S/O

Réfrigérer ou congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur des blocs réfrigérants.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Infection par N. gonorrhoeae.

Formulaire de demande LNM GC TAAN rempli, avec le nom, l’adresse, le numéro de téléphone et l’adresse électronique du laboratoire expéditeur. Tous les renseignements sur les patients doivent être fournis, y compris l’identifiant (numéro de référence de l’échantillon), la date de naissance et le sexe du patient, la plate-forme d’analyse, la date de prélèvement, le site d’isolement et l’analyse demandée. S’il s’agit d’échantillons urgents, il faut le mentionner dans la demande et aviser le laboratoire avant qu’il ne les reçoive.

S/O

Les échantillons positifs pour la gonorrhée, prélevés par TAAN et reçus au LNM  en vue d’un test PCR, font d’abord l’objet d’une extraction à l’aide d’un kit disponible dans le commerce. Des tests qPCR de polymorphisme nucléotidique simple (SNP) sont utilisés pour prédire la résistance aux antimicrobiens (RAM) vis-à-vis des céphalosporines (céfixime/ceftriaxone), de la ciprofloxacine et de l’azithromycine (1). L’échantillon est également testé pour le gène porA afin de confirmer l’identification de N. gonorrhoeae, ainsi que pour la RNaseP afin de s’assurer que l’extraction d’ADN a été réussie. Les résultats sont destinés uniquement à des fins de surveillance et ne doivent pas être utilisés pour la prise en charge individuelle d’un patient.

S/O

1. Peterson SW, Martin I, Demczuk W, Barairo N, Naidu P, Lefebvre B, Allen V, Hoang L, Hatchette TF, Alexander D, Tomas K, Trubnikov M, Wong T, Mulvey MR. Multiplex real-time PCR assays for the prediction of cephalosporin, ciprofloxacin and azithromycin antimicrobial susceptibility of positive Neisseria gonorrhoeae nucleic acid amplification test samples. J Antimicro Chemo. 2020; 75: 3485-3490.